Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms