Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRHP20396 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRHP20396 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRHP20396 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
TRHP20396 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRHP20396 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRHP20396 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRHP20396 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRHP20396 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRHP20396 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRHP20396 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRHP20396 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRHP20396 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRHP20396 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRHP20396 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRHP20396 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRHP20396 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRHP20396 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
TRHP20396 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRHP20396 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRHP20396 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms