Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIG1P18858 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIG1P18858 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIG1P18858 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIG1P18858 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIG1P18858 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIG1P18858 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIG1P18858 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIG1P18858 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIG1P18858 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIG1P18858 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIG1P18858 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIG1P18858 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIG1P18858 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms