Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCP1P17987 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCP1P17987 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCP1P17987 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCP1P17987 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCP1P17987 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCP1P17987 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms