Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYN1P17600 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYN1P17600 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYN1P17600 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYN1P17600 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYN1P17600 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYN1P17600 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms