Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7P17544 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7P17544 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7P17544 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms