Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB4P17483 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB4P17483 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms