Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD1P17405 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms