Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB4P16144 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB4P16144 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB4P16144 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB4P16144 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB4P16144 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB4P16144 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB4P16144 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms