Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-EP13747 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-EP13747 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms