Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIP12755 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIP12755 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIP12755 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIP12755 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIP12755 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIP12755 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIP12755 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIP12755 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIP12755 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIP12755 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIP12755 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIP12755 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms