Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT3P12035 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT3P12035 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT3P12035 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT3P12035 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT3P12035 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT3P12035 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT3P12035 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms