Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms