Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4AP0C0L4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms