Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXB7P09629 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms