Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRCP08575 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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