Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP3P08254 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMP3P08254 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP3P08254 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP3P08254 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP3P08254 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms