Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB1P08034 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB1P08034 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB1P08034 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB1P08034 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB1P08034 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB1P08034 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB1P08034 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB1P08034 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB1P08034 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms