Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APODP05090 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APODP05090 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APODP05090 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APODP05090 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APODP05090 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APODP05090 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APODP05090 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APODP05090 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APODP05090 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APODP05090 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APODP05090 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APODP05090 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APODP05090 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms