Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTNP04004 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTNP04004 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTNP04004 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTNP04004 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTNP04004 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTNP04004 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTNP04004 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTNP04004 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms