Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGAP02671 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FGAP02671 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGAP02671 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FGAP02671 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FGAP02671 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGAP02671 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGAP02671 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGAP02671 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGAP02671 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms