Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX58O95786 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX58O95786 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX58O95786 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms