Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN7O95471 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN7O95471 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN7O95471 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms