Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms