Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC31AO94979 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC31AO94979 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31AO94979 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31AO94979 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms