Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOBTB3O94955 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms