Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG12O94817 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG12O94817 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms