Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms