Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SKAP2O75563 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms