Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms