Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms