Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND1O60716 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms