Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSCO60682 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSCO60682 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSCO60682 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSCO60682 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSCO60682 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSCO60682 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSCO60682 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSCO60682 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSCO60682 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSCO60682 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MSCO60682 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSCO60682 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms