Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP10AO60312 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP10AO60312 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms