Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms