Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms