Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALUO43852 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALUO43852 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALUO43852 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALUO43852 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALUO43852 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALUO43852 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALUO43852 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALUO43852 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALUO43852 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALUO43852 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALUO43852 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALUO43852 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALUO43852 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CALUO43852 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALUO43852 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALUO43852 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALUO43852 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms