Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms