Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATCO43716 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATCO43716 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATCO43716 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATCO43716 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATCO43716 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms