Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP3O43295 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP3O43295 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms