Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIAH2O43255 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms