Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXC11O43248 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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