Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEFVO15553 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEFVO15553 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms