Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2DO15399 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms