Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBTB39O15060 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBTB39O15060 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms