Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF6O14896 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF6O14896 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF6O14896 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF6O14896 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF6O14896 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms