Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms