Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIP1O00291 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIP1O00291 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIP1O00291 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIP1O00291 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIP1O00291 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIP1O00291 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms