Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms