Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms